Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F5

Mrnip, MRN complex-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MrnipQ9D1F5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MrnipQ9D1F5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MrnipQ9D1F5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms