Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lmbr1lQ9D1E5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lmbr1lQ9D1E5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms