Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syf2Q9D198 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Syf2Q9D198 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms