Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2fQ9CY34 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2fQ9CY34 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms