Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX19

Fam162b, Protein FAM162B, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam162bQ9CX19 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Fam162bQ9CX19 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Fam162bQ9CX19 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fam162bQ9CX19 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Fam162bQ9CX19 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Fam162bQ9CX19 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Fam162bQ9CX19 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Fam162bQ9CX19 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Fam162bQ9CX19 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam162bQ9CX19 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms