Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pin4Q9CWW6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pin4Q9CWW6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms