Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NubplQ9CWD8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NubplQ9CWD8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NubplQ9CWD8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms