Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Otud1Q9CUB6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Otud1Q9CUB6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms