Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fcf1Q9CTH6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcf1Q9CTH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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