Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm7sf3Q9CRG1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm7sf3Q9CRG1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms