Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NmbQ9CR53 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NmbQ9CR53 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms