Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr3kQ9CQZ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr3kQ9CQZ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms