Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PompQ9CQT5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PompQ9CQT5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms