Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atg3Q9CPX6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atg3Q9CPX6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms