Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bcl11bQ99PV8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bcl11bQ99PV8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bcl11bQ99PV8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms