Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ubxn6Q99PL6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ubxn6Q99PL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms