Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrc4Q99PH1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lrrc4Q99PH1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms