Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc24a3Q99PD7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc24a3Q99PD7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms