Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vgll1Q99NC0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vgll1Q99NC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms