Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atoh8Q99NA2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atoh8Q99NA2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atoh8Q99NA2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atoh8Q99NA2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atoh8Q99NA2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atoh8Q99NA2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms