Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ms4a4dQ99N05 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4dQ99N05 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms