Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gins4Q99LZ3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gins4Q99LZ3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms