Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nus1Q99LJ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nus1Q99LJ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms