Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TriobpQ99KW3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TriobpQ99KW3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms