Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Me2Q99KE1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me2Q99KE1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms