Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp11Q99K46 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp11Q99K46 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms