Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tlcd1Q99JT6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tlcd1Q99JT6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms