Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Apobec3Q99J72 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apobec3Q99J72 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms