Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn16Q925N4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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