Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PdgfdQ925I7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PdgfdQ925I7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PdgfdQ925I7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms