Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpe65Q91ZQ5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rpe65Q91ZQ5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpe65Q91ZQ5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpe65Q91ZQ5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpe65Q91ZQ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rpe65Q91ZQ5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rpe65Q91ZQ5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms