Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppargc1bQ8VHJ7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms