Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fyco1Q8VDC1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fyco1Q8VDC1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Fyco1Q8VDC1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms