Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hecw1Q8K4P8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hecw1Q8K4P8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hecw1Q8K4P8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hecw1Q8K4P8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms