Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ltbp4Q8K4G1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ltbp4Q8K4G1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms