Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abca5Q8K448 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Abca5Q8K448 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Abca5Q8K448 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms