Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrtm1Q8K377 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrtm1Q8K377 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms