Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nsl1Q8K305 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nsl1Q8K305 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms