Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf39Q8K2Z2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms