Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm48Q8K2X2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbm48Q8K2X2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm48Q8K2X2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms