Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Neil3Q8K203 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms