Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Setd1bQ8CFT2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Setd1bQ8CFT2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Setd1bQ8CFT2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Setd1bQ8CFT2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Setd1bQ8CFT2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Setd1bQ8CFT2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms