Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cwc22Q8C5N3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cwc22Q8C5N3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cwc22Q8C5N3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms