Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfrp1Q8C4U3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms