Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rft1Q8C3B8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rft1Q8C3B8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms