Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp54Q8BL06 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp54Q8BL06 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp54Q8BL06 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms