Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tspan12Q8BKT6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tspan12Q8BKT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tspan12Q8BKT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms