Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnrc6bQ8BKI2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnrc6bQ8BKI2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms