Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc155Q80VJ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc155Q80VJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc155Q80VJ8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms