Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Clasp1Q80TV8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Clasp1Q80TV8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Clasp1Q80TV8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms